Le microtome est un instrument qui permet de réaliser des coupes dans des tissus animaux ou végétaux. Le corps du microtome est équipé d'un porte-échantillon dont le système d'entraînement permet de fixer l'épaisseur de la coupe, d'un rasoir fixe en acier (ici manquant), d’un porte couteau (ici manquant), d’une poignée qui permet de monter ou descendre l’objet et d’un disque gradué pour déterminer l’épaisseur en microns. L'appareil est commandé manuellement.L’échantillon de paraffine coulisse et passe alors sur le fil du rasoir. Les coupes obtenues se présentent sous forme de rubans très fins.